Huyện Hóc Môn nằm ở phía tây bắc của TP. Hồ Chí Minh, tiếp giáp với các quận – huyện – thành phố là:
- Phía đông tiếp giáp TP Thuận An, tỉnh Bình Dương với ranh giới chính là sông Sài Gòn
- Phía tây tiếp giáp huyện Đức Hòa – tỉnh Long An
- Phía nam tiếp giáp Quận 12, huyện Bình Chánh và quận Bình Tân
- Phía bắc tiếp giáp huyện Củ Chi