Huyện Hóc Môn có 1 thị trấn và 11 xã, cụ thể:
- Thị trấn Hóc Môn
- Xã Bà Điểm
- Xã Đông Thạnh
- Xã Nhị Bình
- Xã Tân Hiệp
- Xã Tân Thới Nhì
- Xã Tân Xuân
- Xã Thới Tam Thôn
- Xã Trung Chánh
- Xã Xuân Thới Đông
- Xã Xuân Thới Sơn
- Xã Xuân Thới Thượng
Trong đó, thị trấn Hóc Môn là địa chỉ đặt UBND và các cơ quan hành chính của Hóc Môn.
